Seriál sleduje plavby hvězdné lodi Hvězdné flotily USS Enterprise (NCC-1701), jejímž kapitánem byl Christopher Pike, během její druhé pětileté mise (2259-2264), která předchází pětileté misi kapitána Jamese T. Kirka vyprávěné v televizním seriálu Star Trek. Seriál navazuje na hvězdné datum 1738.12 (2259), několik let po událostech, které se odehrály ve druhé sérii televizního seriálu Star Trek: Discovery, kdy Pike dočasně vedl USS Discovery.